Pro směnný provoz platí obecná hygienická pravidla na pracovišti. Více podrobností najdete u tématu Hygienická prevence na pracovišti.
Specifikem u směnného provozu je střídání zaměstnanců ve více směnách během dne. V těchto situacích se velmi doporučuje, abyste nepřišli do kontaktu se zaměstnanci jiných směn. Doporučuje se tedy omezit počet osob v šatnách a sprchách, zejména u dělnických profesí. Ideálním scénářem by bylo rozdělit zaměstnance do několika týmů či skupin, které se nebudou setkávat na pracovišti v jeden okamžik.